MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Actinoplanes friuliensis DSM 7358

Total Repeats: 236614

< Previous12...462463464465466467468469470471472473474Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
236501	NC_022657	CGT	2	6	9369593	9369598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556571475
236502	NC_022657	CCGG	2	8	9369612	9369619	0 %	0 %	50 %	50 %	556571475
236503	NC_022657	GCC	2	6	9369659	9369664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556571475
236504	NC_022657	TTC	2	6	9369675	9369680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556571475
236505	NC_022657	TCA	2	6	9369771	9369776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556571476
236506	NC_022657	GCG	2	6	9369895	9369900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556571476
236507	NC_022657	CAG	2	6	9369913	9369918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556571476
236508	NC_022657	TGT	2	6	9369969	9369974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556571476
236509	NC_022657	TGA	2	6	9369975	9369980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556571476
236510	NC_022657	GTA	2	6	9370003	9370008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556571476
236511	NC_022657	CCT	2	6	9370032	9370037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556571476
236512	NC_022657	CGG	2	6	9370078	9370083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556571476
236513	NC_022657	CG	3	6	9370129	9370134	0 %	0 %	50 %	50 %	556571476
236514	NC_022657	CGA	2	6	9370155	9370160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556571476
236515	NC_022657	TGG	2	6	9370197	9370202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556571476
236516	NC_022657	GTG	2	6	9370303	9370308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556571476
236517	NC_022657	CGA	2	6	9370353	9370358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556571476
236518	NC_022657	GTC	2	6	9370406	9370411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556571476
236519	NC_022657	CGC	2	6	9370425	9370430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556571476
236520	NC_022657	CG	3	6	9370455	9370460	0 %	0 %	50 %	50 %	556571476
236521	NC_022657	ATG	2	6	9370478	9370483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556571476
236522	NC_022657	GCC	2	6	9371608	9371613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556571477
236523	NC_022657	GCC	2	6	9371642	9371647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556571477
236524	NC_022657	CGA	2	6	9371700	9371705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556571477
236525	NC_022657	CGG	2	6	9371713	9371718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556571477
236526	NC_022657	GAC	2	6	9371746	9371751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556571477
236527	NC_022657	CAC	2	6	9371760	9371765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556571477
236528	NC_022657	TCGCG	2	10	9371778	9371787	0 %	20 %	40 %	40 %	556571477
236529	NC_022657	CAG	2	6	9371830	9371835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556571477
236530	NC_022657	GCC	2	6	9371839	9371844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556571477
236531	NC_022657	GCG	2	6	9371849	9371854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556571477
236532	NC_022657	GGCA	2	8	9371858	9371865	25 %	0 %	50 %	25 %	556571477
236533	NC_022657	GCG	2	6	9371886	9371891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556571477
236534	NC_022657	CG	5	10	9371896	9371905	0 %	0 %	50 %	50 %	556571477
236535	NC_022657	GAC	2	6	9371908	9371913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556571477
236536	NC_022657	GCG	2	6	9371921	9371926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556571477
236537	NC_022657	G	6	6	9371926	9371931	0 %	0 %	100 %	0 %	556571477
236538	NC_022657	CGA	2	6	9371937	9371942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556571477
236539	NC_022657	TCC	2	6	9371945	9371950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556571477
236540	NC_022657	GAC	2	6	9371962	9371967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556571477
236541	NC_022657	TCG	2	6	9372022	9372027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556571477
236542	NC_022657	GTCA	2	8	9372112	9372119	25 %	25 %	25 %	25 %	556571477
236543	NC_022657	ATC	2	6	9372137	9372142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556571477
236544	NC_022657	CGC	2	6	9372153	9372158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556571477
236545	NC_022657	ACG	2	6	9372218	9372223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556571477
236546	NC_022657	AGC	2	6	9372236	9372241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556571477
236547	NC_022657	GCC	2	6	9372254	9372259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556571477
236548	NC_022657	TCAG	2	8	9372868	9372875	25 %	25 %	25 %	25 %	556571478
236549	NC_022657	GCG	2	6	9372892	9372897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556571478
236550	NC_022657	CGT	2	6	9372951	9372956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556571478
236551	NC_022657	GCG	2	6	9373060	9373065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556571478
236552	NC_022657	CCG	2	6	9373079	9373084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556571478
236553	NC_022657	AGG	3	9	9373091	9373099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556571478
236554	NC_022657	CG	3	6	9373117	9373122	0 %	0 %	50 %	50 %	556571478
236555	NC_022657	CGA	2	6	9373179	9373184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556571478
236556	NC_022657	GCCG	2	8	9373194	9373201	0 %	0 %	50 %	50 %	556571478
236557	NC_022657	GGC	2	6	9373221	9373226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556571478
236558	NC_022657	CCG	2	6	9373227	9373232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556571478
236559	NC_022657	TCG	2	6	9373241	9373246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556571478
236560	NC_022657	CGT	2	6	9373254	9373259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556571478
236561	NC_022657	AGC	2	6	9373274	9373279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556571478
236562	NC_022657	CGG	2	6	9373293	9373298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556571478
236563	NC_022657	CGT	2	6	9373330	9373335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556571478
236564	NC_022657	CTT	2	6	9373348	9373353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556571478
236565	NC_022657	CGG	2	6	9373368	9373373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556571478
236566	NC_022657	CGG	2	6	9373380	9373385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556571478
236567	NC_022657	TTG	2	6	9373609	9373614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556571479
236568	NC_022657	CTT	2	6	9373629	9373634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556571479
236569	NC_022657	ACG	2	6	9373684	9373689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556571479
236570	NC_022657	CGGCTC	2	12	9373698	9373709	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	556571479
236571	NC_022657	GGC	3	9	9373710	9373718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556571479
236572	NC_022657	TGC	2	6	9373820	9373825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556571479
236573	NC_022657	CGG	4	12	9373845	9373856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556571479
236574	NC_022657	CTG	3	9	9373875	9373883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556571479
236575	NC_022657	GTT	2	6	9373899	9373904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556571479
236576	NC_022657	AGC	2	6	9373954	9373959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556571479
236577	NC_022657	ATC	2	6	9373993	9373998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556571479
236578	NC_022657	CTG	2	6	9374001	9374006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556571479
236579	NC_022657	ATC	2	6	9374035	9374040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556571479
236580	NC_022657	GGC	2	6	9374042	9374047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556571479
236581	NC_022657	AGGT	2	8	9374053	9374060	25 %	25 %	50 %	0 %	556571479
236582	NC_022657	CAT	2	6	9374067	9374072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556571479
236583	NC_022657	GAT	2	6	9374094	9374099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556571479
236584	NC_022657	GGA	2	6	9374145	9374150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556571479
236585	NC_022657	GCG	2	6	9374168	9374173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556571479
236586	NC_022657	GTGG	2	8	9374190	9374197	0 %	25 %	75 %	0 %	556571479
236587	NC_022657	CTG	2	6	9374235	9374240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556571479
236588	NC_022657	GCC	2	6	9374258	9374263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556571479
236589	NC_022657	CAT	2	6	9374358	9374363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556571479
236590	NC_022657	TTCT	2	8	9374364	9374371	0 %	75 %	0 %	25 %	556571479
236591	NC_022657	GCA	2	6	9374405	9374410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556571479
236592	NC_022657	CAC	2	6	9374496	9374501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556571479
236593	NC_022657	GGA	3	9	9374591	9374599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556571479
236594	NC_022657	GTA	2	6	9374613	9374618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556571479
236595	NC_022657	CAG	2	6	9374655	9374660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556571480
236596	NC_022657	GCC	2	6	9374727	9374732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556571480
236597	NC_022657	CCT	2	6	9374778	9374783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556571480
236598	NC_022657	ACG	2	6	9374845	9374850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556571480
236599	NC_022657	CGA	2	6	9374856	9374861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556571480
236600	NC_022657	CGC	3	9	9374917	9374925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556571481
236601	NC_022657	GAT	2	6	9374929	9374934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556571481
236602	NC_022657	GGC	2	6	9374937	9374942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556571481
236603	NC_022657	G	6	6	9374997	9375002	0 %	0 %	100 %	0 %	556571481
236604	NC_022657	GC	3	6	9375005	9375010	0 %	0 %	50 %	50 %	556571481
236605	NC_022657	ACC	2	6	9375013	9375018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556571481
236606	NC_022657	GTG	2	6	9375022	9375027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556571481
236607	NC_022657	CCG	2	6	9375028	9375033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556571481
236608	NC_022657	GCC	3	9	9375071	9375079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556571481
236609	NC_022657	TTG	2	6	9375085	9375090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556571481
236610	NC_022657	GAC	2	6	9375093	9375098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556571481
236611	NC_022657	GC	4	8	9375133	9375140	0 %	0 %	50 %	50 %	556571481
236612	NC_022657	TGCGCA	2	12	9375369	9375380	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	556571482
236613	NC_022657	GC	3	6	9375401	9375406	0 %	0 %	50 %	50 %	556571482
236614	NC_022657	CGG	2	6	9375407	9375412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556571482

< Previous12...462463464465466467468469470471472473474Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.